生信在线分析平台

科研级生物信息学工具,浏览器内完成分析 — 数据不上传服务器,隐私安全。目录共 270 个工具,已上线 270 个,持续扩充中。

已上线工具

基础热图

带行列聚类的热图,支持样本/基因注释条与多种配色

已上线 · plot

条目气泡图

四列数据绘制气泡图,气泡大小关联连续变量

已上线 · plot

基础火山图

组学差异分析最常用的可视化,log2FC 对 -log10P

已上线 · plot

韦恩图

可视化 2-5 组集合之间的重叠与差异

已上线 · plot

主成分分析

PCA 降维与特征提取,得分图+方差解释率

已上线 · dimredu

代谢组复杂热图

简单热图基础上增加多元素注释

已上线 · plot

相关性分析流程

计算两组学数据之间的相关性系数

已上线 · network

蛋白质组复杂热图

蛋白表达复杂热图,多元素注释

已上线 · plot

丰度分析批量绘图

对列表中物质的表达值批量比较绘图

已上线 · batch

双色火山图

差异分析结果的双色着色可视化

已上线 · plot

KEGG 通路条形图及气泡图

KEGG 通路富集结果条形图与气泡图

已上线 · enrich

VIP-p值-FC筛选火山图

按 VIP 值与 p 值筛选物质着色的火山图

已上线 · diff

转录组火山图

转录组差异倍数与 p 值数据绘图

已上线 · plot

通路桑基图

KEGG 通路分析结果桑基图

已上线 · enrich

GO 富集气泡图

GO 富集结果分面气泡图呈现

已上线 · enrich

饼图/圆环图

饼图与圆环图,单色系与多色系配色

已上线 · plot

相关性系数热图

矩阵数据两两相关性系数热图

已上线 · network

FC-VIP 图

展示重要程度较高的差异代谢物

已上线 · diff

环形热图

circos 风格圆环化热图

已上线 · plot

上下调占比条形图

直观体现富集程度与上下调占比

已上线 · diff

多组火山图

多组别差异结果同图呈现

已上线 · plot

VIP-p值筛选火山图

OPLS-DA VIP 值筛选的火山图

已上线 · diff

富集网络图

GO/KEGG 富集结果网络可视化

已上线 · enrich

相关性聚类热图

相关性计算结果的下游聚类可视化

已上线 · network

假设检验分析

数据表单变量 t 检验/非参数检验

已上线 · diff

条形图

单色/多色/分组填色条形图

已上线 · plot

XY轴连续变量气泡图

三个维度呈现数据关系

已上线 · plot

分组小提琴图

展示数据分布并比较不同组

已上线 · plot

色谱峰图

代谢组色谱峰可视化

已上线 · plot

K-means 聚类

最基础常用的划分聚类算法

已上线 · dimredu

OPLS-DA 两组比较分析

正交偏最小二乘判别分析

已上线 · model

共有KEGG通路筛选可视化

多组共有 KEGG 通路筛选展示

已上线 · enrich

批量绘制热图

批量提交数据一次性绘制多张热图

已上线 · batch

SeqLogo 图

展示序列各位点的保守性

已上线 · seq

分面柱状图

带分类信息的分面柱状图

已上线 · plot

柱状图

单色/多色/分组填色柱状图

已上线 · plot

相关性系数与P值计算

计算相关系数及其显著性 P 值

已上线 · network

DAscore 图

基于富集结果的 DAscore 绘图

已上线 · plot

蝴蝶图

双向条形图对比两组数据

已上线 · plot

通路气泡图

展示物质在通路中的富集情况

已上线 · enrich

通路气泡图2

多数据类型 KEGG 富集结果气泡图

已上线 · enrich

根据ID列合并表格

按指定列将两个表格合并

已上线 · processing

分组箱线图

盒须图展示数据分布与异常值

已上线 · plot

PLS-DA 多组比较分析

偏最小二乘判别分析多组比较

已上线 · model

主坐标分析

PCoA 主坐标降维分析

已上线 · dimredu

上下调统计柱状图

多组带标注的上下调数量统计柱状图

已上线 · diff

UpSet 图

多集合交集的 UpSet 可视化

已上线 · plot

差异倍数散点图

直观呈现差异分析结果

已上线 · plot

批量代谢组复杂热图

批量绘制代谢组复杂热图

已上线 · batch

均值聚类及可视化组合图

基于 Mfuzz 的软聚类趋势分析

已上线 · dimredu

物质与通路和弦图

展示物质与通路的对应关系

已上线 · enrich

肽段长度分布图

鉴定肽段的长度分布统计

已上线 · seq

批量绘制饼图/圆环图

批量提交数据绘制多张饼图

已上线 · batch

DESeq2差异分析

基于负二项分布的 RNA-seq 差异分析

已上线 · diff

批量绘制条形图

提交文件批量绘制条形图

已上线 · batch

蛋白ID提取

提取 spectronaut 搜库结果的蛋白 ID

已上线 · seq

批量绘制火山图

多比较组循环绘制火山图

已上线 · batch

批量相关性系数热图

批量矩阵相关性分析出图

已上线 · batch

相关性弦图

相关性分析结果弦图展示

已上线 · network

GO功能分析气泡图

GO 功能富集气泡图

已上线 · enrich

共有通路P值热图

多富集结果共有通路 P 值热图

已上线 · enrich

肽段属性分析

肽段分子量、等电点、疏水性分析

已上线 · seq

亚细胞定位分析图

基于 GO Cellular Component 的定位

已上线 · seq

差异倍数-显著性散点图

按差异倍数与显著性快速出图

已上线 · plot

蛋白ID转换

UniProt Accession 等 ID 转换

已上线 · seq

功能圆环图

上下调分子功能/通路占比圆环图

已上线 · enrich

分隔去重

目标列按分隔符分隔后去重

已上线 · processing

ROC 分析

ROC 曲线与 AUC 分析

已上线 · model

PLS-DA 两组比较分析

偏最小二乘判别两组比较

已上线 · model

差异倍数条形图

差异倍数柱状图展示

已上线 · diff

通路影响图

Pathway Impact 拓扑分析图

已上线 · enrich

Hotelling's T-Squared 检验

霍特林 T 方多元检验

已上线 · diff

KEGG通路批量绘图

KEGG 通路结果批量出图

已上线 · batch

表达量相关性热图

基于表达量的样本相关性热图

已上线 · network

缺失值填充

均值/中位数/最小值等方式填充缺失

已上线 · processing

通路物质统计柱形图2

富集结果中物质数量统计

已上线 · enrich

UniProt库提取信息

从 UniProt 库提取 Accession 等信息

已上线 · seq

相关性系数散点图

目标物质间相关性的散点呈现

已上线 · network

分类火山图

经典火山图改进版,分类着色

已上线 · plot

相关性系数九象限图

相关性分析的九象限呈现

已上线 · network

ID列表抽提表格

按 ID 列表提取目标表格行

已上线 · processing

样本随机化

样本列随机化排序

已上线 · processing

FASTA序列提取

从 FASTA 文件提取指定 ID 序列

已上线 · seq

多组ROC曲线

多组别敏感性特异性曲线

已上线 · model

Spectronaut搜库肽段信息合并

合并 Spectronaut 肽段结果

已上线 · processing

两组差异雷达图

雷达图展示两组数据差异

已上线 · plot

K-means最优K值估计

肘部法则与轮廓系数估计簇数

已上线 · dimredu

GSVA 富集分析

非参数基因集变异分析

已上线 · enrich

保留时间矫正

跨液相系统保留时间校正

已上线 · processing

九象限图(同水平两组)

同水平两组数据九象限图

已上线 · plot

P-value 校正

BH/Bonferroni 等多重检验校正

已上线 · diff

花瓣图

多集合花瓣状韦恩图

已上线 · plot

数据归一化

log/Z-score/Min-Max/CPM 等归一化

已上线 · processing

O2PLS 分析

O2PLS 两组学联合建模

已上线 · model

GO分类抖动图

GO 分类结果的抖动散点图

已上线 · enrich

双Y轴折线图

同图展示两个不同量纲变量

已上线 · plot

批量蛋白质组复杂热图

批量绘制蛋白复杂热图

已上线 · batch

相关性矩阵散点图

样本间相关性矩阵散点呈现

已上线 · network

丰度排序散点图

样本中物质丰度排序展示

已上线 · plot

通路PPI网络图

富集结果提取 PPI 网络

已上线 · enrich

KEGG通路圆环图

Top 15 通路环形占比图

已上线 · enrich

通路z-score与P值气泡图

含 z-score 信息的通路气泡图

已上线 · enrich

OPLS-DA S-plot图

OPLS-DA 载荷 S-plot 可视化

已上线 · model

limma差异分析

微阵列/RNA-seq 线性模型差异分析

已上线 · diff

RDA/CCA

冗余分析/典范对应分析

已上线 · dimredu

相关性系数分布柱形图

相关系数分布柱形图

已上线 · network

激酶富集分析柱状图

激酶底物富集双向柱状图

已上线 · enrich

SPIA火山图

SPIA 通路分析火山图

已上线 · enrich

堆叠柱状图

多分类堆叠柱状图

已上线 · plot

按分类填色的环形柱状图

分类数据环形(极坐标)柱状图

已上线 · plot

环形韦恩图

环形布局的集合关系图

已上线 · plot

模糊c均值聚类分析

模糊 C-均值软聚类

已上线 · dimredu

蛋白结构域分析

差异蛋白的结构域富集分析

已上线 · seq

KEGG通路数量柱状图

通路中基因数量柱状图

已上线 · enrich

树状图

表达矩阵样本聚类树

已上线 · dimredu

FPKM转化TPM

FPKM 与 TPM 定量值互转

已上线 · processing

差异倍数显著性点图

显著上调差异倍数点图

已上线 · diff

风向玫瑰图

极坐标风向玫瑰图

已上线 · plot

随机森林模型基础流程

随机森林分类建模流程

已上线 · model

物质相关性弦图

感兴趣物质的相关性弦图

已上线 · network

欧拉图

面积比例欧拉集合关系图

已上线 · plot

批量绘制环形热图

批量 circos 风格环形热图

已上线 · batch

Grimon多组学网络可视化

多组学关联网络可视化

已上线 · network

总表达量与差异倍数散点图(强度渐变版)

总表达强度与差异倍数渐变散点

已上线 · plot

ENSEMBL转SYMBOL

ENSEMBL ID 转 SYMBOL/ENTREZ

已上线 · seq

转录组数据VST或rlog标准化

DESeq2 方差稳定变换标准化

已上线 · processing

双组学联合分析热图

蛋白-转录联合分析聚类热图

已上线 · plot

非度量多维尺度分析

NMDS 非度量降维排序

已上线 · dimredu

列信息截断

过长名称智能截短

已上线 · processing

多组生存分析

多组别 KM 生存曲线

已上线 · model

蛋白归一化前处理

蛋白鉴定数据归一化处理

已上线 · processing

LASSO回归分析

高维数据 LASSO 变量筛选回归

已上线 · model

三元图

三元数据三角相图

已上线 · plot

提取通路中基因表达信息

按富集表提取通路基因表达

已上线 · seq

ComBat批次校正

SVA ComBat 消除批次效应

已上线 · processing

相关性网络图

相关性结果的网络图呈现

已上线 · network

矩阵数据log变换

log2/log10 等对数变换

已上线 · processing

丰度等级曲线

物质丰度排名曲线

已上线 · plot

糖链长度柱状分布图

糖基化位点糖链长度统计

已上线 · seq

配对连线图

配对样本前后连线比较

已上线 · plot

质控物质散点图

大样本量组学数据质控散点

已上线 · plot

修饰位点数据用蛋白组数据归一化

修饰位点标准化处理

已上线 · processing

表格选定列去重

目标列去重保留首条

已上线 · processing

MA 图

MA(强度-差异)可视化

已上线 · plot

转录因子分析

蛋白/修饰数据的转录因子富集

已上线 · seq

风险因子关联图

风险评分与生存状态关联图

已上线 · model

Z-score评分图

Z-score 得分热图

已上线 · plot

Krona分级可交互饼图

多级交互式饼图

已上线 · plot

表达排序散点图(单组)

单组表达数据排序散点

已上线 · plot

普鲁克分析

Procrustes 构型比较分析

已上线 · dimredu

Z-score标准化

减均值除标准差标准化

已上线 · processing

通路物质统计柱形图3

富集结果物质数量统计

已上线 · enrich

批量丰度分析绘图

多批数据批量丰度比较

已上线 · batch

ssGSEA富集分析

单样本基因集富集分析

已上线 · enrich

PCA 3D散点图1

代谢数据三维主成分散点

已上线 · dimredu

组内正态性与组间方差齐性检验

参数检验前提假设检验

已上线 · diff

单色环形柱状图

分类计数单色环形柱状图

已上线 · plot

平均丰度差异倍数散点图

平均丰度与差异倍数散点

已上线 · plot

TopN数据筛选

按变量排名筛选前 N 数据

已上线 · processing

ANOSIM分析

基于距离的相似性置换检验

已上线 · diff

差异物质数量统计图

Down/Up/NS 分类数量统计

已上线 · diff

HMDB散点图

HMDB 注释信息散点图

已上线 · plot

物种累积曲线

物种数随样本量累积曲线

已上线 · plot

等电点堆叠图

两组等电点分布百分比堆叠

已上线 · plot

森林图

森林图(效应量+置信区间)

已上线 · plot

中位值截断生存曲线

按表达中位数分组的生存曲线

已上线 · model

花瓣图2

多集合花瓣图(变体)

已上线 · plot

表达丰度分区堆积柱状图

丰度分区占比堆积柱状图

已上线 · plot

Adonis置换方差分析

PERMANOVA 置换方差分析

已上线 · diff

分组柱状图

多组并列柱状图

已上线 · plot

通用散点图

两连续变量散点图

已上线 · plot

总表达量与差异倍数散点图

总表达强度与差异倍数散点

已上线 · plot

鉴定到物质数量分析

大队列鉴定物质数量统计

已上线 · plot

糖型共现热图

完整糖肽糖型共现热图

已上线 · plot

九象限图流程版

两组学联合九象限图

已上线 · plot

多组差异表达气泡图

多组差异结果气泡呈现

已上线 · diff

组织特异性分析

基于表达的组织特异性计算

已上线 · seq

截断柱状图

极端数值差异的截断轴柱状图

已上线 · plot

流动堆叠柱状图

Alluvial 冲积堆叠柱状图

已上线 · plot

核密度曲线图

核密度估计分布曲线

已上线 · plot

分面直方图

按分类变量分面直方图

已上线 · plot

扇形图

扇形百分比展示

已上线 · plot

批量亚细胞定位分析图

批量 GO CC 亚细胞定位

已上线 · seq

TSNE降维及可视化

t-SNE 非线性降维可视化

已上线 · dimredu

REACTOME富集分析

超几何检验 REACTOME 富集

已上线 · enrich

表格内样本重排序

按参数表顺序重排样本列

已上线 · processing

edgeR差异分析

负二项模型 edgeR 差异分析

已上线 · diff

gProfiler可视化

g:Profiler 富集结果可视化

已上线 · enrich

彗星图

Comet 双数据集轨迹图

已上线 · plot

聚类凸包散点图

聚类结果凸包边界散点

已上线 · dimredu

PCA 3D散点图2

代谢数据三维主成分散点(变体)

已上线 · dimredu

亚类合计柱状图

脂质国际分类亚类统计柱状图

已上线 · plot

树状图(带模块颜色)

带颜色注释的聚类树状图

已上线 · dimredu

环形数据分布图

环形布局数据分布图

已上线 · plot

UMAP降维及可视化

UMAP 非线性降维可视化

已上线 · dimredu

词云图

文本词频词云可视化

已上线 · plot

概率密度散点图

带概率密度边缘的散点图

已上线 · plot

密度散点图

高密度散点核密度着色

已上线 · plot

多层甜甜圈图

多组占比嵌套圆环图

已上线 · plot

FPKM密度分布

转录组 FPKM 密度分布曲线

已上线 · plot

平均丰度显著性散点图

平均丰度与 p 值散点图

已上线 · plot

激酶底物网络分析

KSEA 结果网络可视化

已上线 · network

Signor3数据库注释

信号转导网络数据库注释

已上线 · seq

激酶底物关系弦图

激酶-底物对应关系弦图

已上线 · network

Ontology统计图

脂质国际分类统计图

已上线 · plot

相关性柱形图

相关性结果柱形图可视化

已上线 · network

相关性火柴棒图

相关性结果火柴棒可视化

已上线 · network

P值散点图

-lg(p) 排序散点图

已上线 · diff

置换检验

Bootstrap 置换检验

已上线 · diff

碳链长度气泡图

脂质碳链长度气泡图

已上线 · plot

抽样相关性分析

大队列两组样本相关性分析

已上线 · network

表达排序散点图(多组)

多组表达数据排序散点

已上线 · plot

峰峦图

分组密度峰峦图

已上线 · plot

棒棒糖图

棒棒糖图(点+线组合)

已上线 · plot

面积图

堆叠面积图

已上线 · plot

蜂群图

多组单变量蜂群分布

已上线 · plot

折线图(网页版)

通用折线图

已上线 · plot

3D火山图

三维交互式火山图

已上线 · plot

WikiPathway富集分析

WikiPathway 通路富集

已上线 · enrich

多组数据柱状图

多比较组多指标带标注柱状图

已上线 · plot

gProfiler富集结果绘图

g:Profiler 富集结果绘图

已上线 · enrich

种子基因子网络构建

以种子基因为中心构建子网络

已上线 · network

多集合韦恩图

多集合交集与特有元素

已上线 · plot

多层环形图

多比较组/多分类层占比

已上线 · plot

配对样本差值正态性检验

配对设计差值正态性检验

已上线 · diff

通路活性推断

PROGENy 通路活性评分

已上线 · enrich

3D散点图

三维交互散点图

已上线 · plot

SAM差异分析

微阵列显著性分析

已上线 · diff

华夫图

华夫饼格占比图

已上线 · plot

人源血液蛋白浓度关联分析器

HPA 血液蛋白浓度关联

已上线 · seq

旭日图

层级旭日(饼图变形)

已上线 · plot

半小提琴图

半小提琴分布图

已上线 · plot

基因排布箭头图

多物种基因结构比较

已上线 · seq

包珠图

Circle Packing 层级包珠

已上线 · plot

点棒热图

点+棒组合热图

已上线 · plot

概率密度分布图

概率密度估计曲线

已上线 · plot

云雨图

半小提琴+散点云雨图

已上线 · plot

基因-通路网络图

差异基因与通路关联网络

已上线 · enrich

HPA数据库注释

Human Protein Atlas 注释

已上线 · seq

分组统计

表达矩阵按分组统计量计算

已上线 · diff

混合库去重

多库搜库结果合并去重

已上线 · processing

事后检验

ANOVA 事后多重比较

已上线 · diff

ESTIMATE免疫浸润分析(人源)

肿瘤纯度与免疫评分评估

已上线 · model

16s rRNA差异丰度提取

16S 差异丰度表提取

已上线 · seq

沃洛诺伊图

Voronoi 层次面积分割图

已上线 · plot

矩形树图

父子层级矩形树图

已上线 · plot

议会图

议会席位式占比图

已上线 · plot

QQ图(曼哈顿图)

QQ图/曼哈顿图/SNP密度图

已上线 · plot

分类气泡图

分类着色气泡图

已上线 · plot

序列比对

双序列 NW/SW 比对与多序列渐进比对,DNA/RNA/蛋白

已上线 · seq

转录因子结合位点预测

基于 JASPAR 2026 PWM 扫描预测 TFBS,含精确 p 值

已上线 · seq

sgRNA 设计

CRISPR sgRNA 设计,支持 SpCas9/SaCas9/Cas12a,GC 与脱靶初评

已上线 · seq

密码子优化器

按目标宿主密码子偏好优化编码序列,输出 CAI 与 GC 对比

已上线 · seq

CpG 岛检测

Gardiner-Garden 标准识别基因组 CpG 岛区域

已上线 · seq

蛋白质二级结构预测

Chou-Fasman 算法预测 α-螺旋/β-折叠/无规卷曲

已上线 · seq

RNA 二级结构预测

Nussinov 碱基配对最大化 + 弧图与点括号输出

已上线 · seq

多数据库富集分析

13 个基因集库超几何富集,支持人/小鼠

已上线 · enrich

生存资料最佳截断值

LogRank χ² 扫描最佳 cutoff,KM 分组与二分 Cox HR

已上线 · model

Cox 列线图

Cox 回归列线图,Breslow 基线预测指定时间点生存概率

已上线 · model

风险得分三联图

单因素筛选→多因素 Cox→风险得分:条形/生存状态/KM/表达热图

已上线 · model

GBM 预后特征筛选

梯度提升 Cox 多 seed 平均特征重要性排序

已上线 · model

LASSO-Cox 筛选

λ 系数路径 + 5 折 CV + 1-SE 规则的 LASSO-Cox 变量筛选

已上线 · model

误差棒图

分组均值 ± SD/SEM/CI95 误差棒柱形/散点图,附 Welch t 检验

已上线 · plot

哑铃图

两时点数值变化哑铃图,按差值绝对值排序

已上线 · plot

漏斗图

阶段数值漏斗图,占比与最大衰减环节分析

已上线 · plot

STAMP 差异条形图

特征分组均值 ± 置信区间水平条形图,附 Welch t 检验表

已上线 · plot

双 Y 轴柱线图

柱形(左轴)与折线(右轴)双轴组合图

已上线 · plot

配对箱线图

配对样本箱线图 + 个体配对连线与相邻条件配对 t 检验

已上线 · plot

中国地图填色图

省份数值填色地图,支持省市简称自动匹配

已上线 · plot

世界地图填色图

国家数值填色地图,支持中文国名自动匹配

已上线 · plot

工具目录

热图、火山图、韦恩图、主成分分析(PCA)、K-means 聚类、假设检验、P 值多重校正、相关性分析、数据归一化、缺失值填补、GO/KEGG 富集可视化等,覆盖转录组、蛋白质组、代谢组等组学场景。